Luigi remporte un manoir et y invite son frère Mario pour célébrer. À son arrivée, Luigi découvre que Mario a disparu. Il est attaqué par un fantôme et sauvé par le professeur E. Gadd. Le professeur équipe Luigi d'un Ectoblast 3000 et d'une Game Boy Horror pour explorer le manoir et retrouver Mario.

Le gameplay consiste à éclairer les fantômes avec une lampe torche pour les surprendre, puis à les aspirer avec l'Ectoblast 3000. Lorsqu'un fantôme tente de s'enfuir, il faut incliner rapidement le stick dans la direction opposée et répéter le mouvement pour l'affaiblir.

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